Nous sommes préoccupés par l'identification erronée de coronavirus directement dans les tissus par des auteurs utilisant la microscopie électronique. Plusieurs articles récents ont été publiés qui prétendent avoir identifié le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) directement dans les tissus. La plupart décrivent des particules qui ressemblent aux coronavirus, mais qui n'en ont pas l'apparence.
Les preuves fournies dans l'article de Farkash et al.8 dans JASN ne confirment pas non plus la présence du SRAS-CoV-2 dans les tissus rénaux. Les coronavirus ont été soigneusement décrits dans des images de microscopie électronique de sections minces. Dans ces images de sections minces, les coronavirus apparaissent comme des structures sphériques contenant des points noirs à l'intérieur, qui sont des coupes transversales à travers la nucléocapside virale hélicoïdale (Figure 1). Les coronavirus reçoivent leur enveloppe extérieure par bourgeonnement dans les membranes cellulaires du réticulum endoplasmique rugueux et du complexe de Golgi formant une vacuole et se trouvant dans l'espace intracisternal. Les pointes sont difficilement visibles dans les coupes fines des cellules infectées, mais un "duvet" est parfois visible. Il faut cependant noter que ces pointes sont tournées vers l'intérieur de la vacuole et ne touchent pas le cytoplasme de la cellule.
On peut également trouver des particules virales complètes à la surface de la cellule, qui ont été extrudées lorsque la membrane vacuolaire fusionne avec la membrane plasmique et les exocytose ; dans ce cas, les pointes des virions sont orientées vers l'espace extracellulaire, et non vers le cytoplasme.
Figure 1.
Isolat du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère cultivé en culture cellulaire montrant de nombreuses particules virales sphériques (flèches) qui se trouvent dans les citernes de la zone du réticulum endoplasmique rugueux/complexe de Golgi de la cellule. Notez les points noirs à l'intérieur des particules, qui sont des coupes transversales de la nucléocapside virale. Barre d'échelle : 400 nm.
Dans l'article de Farkash et al.8, les images de microscopie électronique de la figure 3, A-C, ne montrent pas de coronavirus. Les structures décrites comme des virus sont plutôt des vésicules recouvertes de clathrine (CCV), des organelles subcellulaires normales impliquées dans le transport intracellulaire. La figure 3A8 est un faible grossissement d'une cellule mourante avec un cytoplasme désorganisé non spécifique et une flèche pointant vers une agrégation de VCC. Les panneaux B et C de la figure 38 montrent des amas de VCC, et l'encart de la figure 3C8 montre un agrandissement plus important. Aucune de ces structures sphériques ne contient de coupes transversales à travers la nucléocapside des particules virales. En outre, ces CCV sont observés libres dans le cytoplasme, alors que les particules de coronavirus sont enfermées dans une vacuole, de sorte que les pointes sont orientées vers l'intérieur du contenu de la vacuole, et non vers le cytoplasme. La figure 3D8 contient un corps multivésiculaire (MVB), qu'ils ont assimilé à des vésicules à double membrane, le complexe de réplication des coronavirus. La structure présentée dans le manuscrit de Farkash et al.8 ne comporte pas les deux membranes étroitement opposées que l'on observe dans les vésicules à double membrane et n'a pas l'apparence de ce qui est présenté dans la référence qu'ils citent.13 En outre, les MVB peuvent être trouvés dans les tissus rénaux observés historiquement.6 De plus, les MVB sont formés par des invaginations d'endosomes et sont des intermédiaires dans le trafic vers les lysosomes.
De plus, Farkash et al.8 documentent leurs résultats en faisant référence à un article de Su et al.2 qui prétend avoir identifié des coronavirus dans les reins. De même, cet article ne montre que des structures cellulaires normales qui, pour le virologue non spécialiste du microscope électronique, peuvent ressembler à des coronavirus. Leur interprétation a été réfutée dans des lettres à l'éditeur de Kidney International.
L'identification des virus n'est pas toujours simple. Il faut prendre en compte le mécanisme de production du virus, notamment sa localisation à l'intérieur des cellules, ainsi que son apparence (taille, forme, motif interne de la nucléocapside et pointes de surface). Il faut veiller à ne pas confondre les organelles cellulaires avec les particules virales.
Divulgations
Tous les auteurs n'ont rien à divulguer.
Financement
Aucun.
Remerciements
Nous remercions le Dr Roosecelis Brasil Martines et le Dr David Howell pour leur revue critique de cette lettre.
Les résultats et les conclusions sont ceux des auteurs et ne représentent pas nécessairement la position des US Centers for Disease Control and Prevention.
Notes de bas de page
Publié en ligne avant l'impression. Date de publication disponible sur www.jasn.org.
Voir les lettres à la rédaction connexes, "Kidney Involvement in COVID-19 : Need for Better Definitions" et "Authors' Reply", respectivement aux pages 2224-2225 et 2225-2226.
Copyright © 2020 par la Société américaine de néphrologie.
Source : https://jasn.asnjournals.org/content/31/9/2223